MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014002	CA	3	6	206675	206680	50 %	0 %	0 %	50 %	294494864
4002	NC_014002	TCTA	2	8	206709	206716	25 %	50 %	0 %	25 %	294494864
4003	NC_014002	GAT	2	6	206748	206753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494864
4004	NC_014002	AAT	2	6	206874	206879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494864
4005	NC_014002	ATA	2	6	206893	206898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494864
4006	NC_014002	TTCC	2	8	206899	206906	0 %	50 %	0 %	50 %	294494864
4007	NC_014002	TGA	2	6	206924	206929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494864
4008	NC_014002	T	6	6	206934	206939	0 %	100 %	0 %	0 %	294494864
4009	NC_014002	TCT	2	6	207000	207005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494864
4010	NC_014002	GAT	2	6	207021	207026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494864
4011	NC_014002	CTG	2	6	207045	207050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494864
4012	NC_014002	CAG	2	6	207072	207077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494864
4013	NC_014002	ACC	2	6	207146	207151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494864
4014	NC_014002	TGT	2	6	207200	207205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494864
4015	NC_014002	GA	3	6	207234	207239	50 %	0 %	50 %	0 %	294494864
4016	NC_014002	TGC	2	6	207286	207291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494864
4017	NC_014002	AAAG	2	8	207359	207366	75 %	0 %	25 %	0 %	294494864
4018	NC_014002	AGA	2	6	207371	207376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494864
4019	NC_014002	ATA	2	6	207390	207395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494864
4020	NC_014002	AG	3	6	207444	207449	50 %	0 %	50 %	0 %	294494864
4021	NC_014002	GGA	2	6	207516	207521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494864
4022	NC_014002	ATCC	2	8	207576	207583	25 %	25 %	0 %	50 %	294494864
4023	NC_014002	GGA	2	6	207666	207671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014002	TTG	2	6	207690	207695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494865
4025	NC_014002	GCTC	2	8	207707	207714	0 %	25 %	25 %	50 %	294494865
4026	NC_014002	AGA	2	6	207718	207723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494865
4027	NC_014002	GA	3	6	207722	207727	50 %	0 %	50 %	0 %	294494865
4028	NC_014002	AAGT	2	8	207729	207736	50 %	25 %	25 %	0 %	294494865
4029	NC_014002	GGA	2	6	207827	207832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494865
4030	NC_014002	ATA	2	6	207933	207938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494865
4031	NC_014002	TGC	2	6	208006	208011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494865
4032	NC_014002	TGA	2	6	208024	208029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494865
4033	NC_014002	TCA	2	6	208065	208070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494865
4034	NC_014002	TGG	2	6	208081	208086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494865
4035	NC_014002	GCA	2	6	208106	208111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494865
4036	NC_014002	GTA	2	6	208253	208258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494865
4037	NC_014002	ACT	2	6	208270	208275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494865
4038	NC_014002	AGT	2	6	208279	208284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494865
4039	NC_014002	TGA	2	6	208332	208337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494865
4040	NC_014002	GTAC	2	8	208403	208410	25 %	25 %	25 %	25 %	294494865
4041	NC_014002	CTT	2	6	208508	208513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494865
4042	NC_014002	CAGAAG	2	12	208581	208592	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294494865
4043	NC_014002	AGT	2	6	208594	208599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494865
4044	NC_014002	AC	3	6	208672	208677	50 %	0 %	0 %	50 %	294494865
4045	NC_014002	AT	3	6	208721	208726	50 %	50 %	0 %	0 %	294494865
4046	NC_014002	CGG	2	6	208732	208737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494865
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4048	NC_014002	GAT	2	6	208779	208784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494865
4049	NC_014002	TCC	2	6	208816	208821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_014002	ACT	2	6	208891	208896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_014002	ATT	2	6	208906	208911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014002	TGCAGG	2	12	209064	209075	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294494866
4053	NC_014002	TTG	2	6	209093	209098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494866
4054	NC_014002	GAC	2	6	209182	209187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494867
4055	NC_014002	CTT	2	6	209261	209266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494867
4056	NC_014002	GAA	2	6	209384	209389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494867
4057	NC_014002	TGA	2	6	209500	209505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494867
4058	NC_014002	GAA	2	6	209513	209518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494867
4059	NC_014002	AGA	2	6	209596	209601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494867
4060	NC_014002	ATT	2	6	209624	209629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_014002	TCAA	2	8	209630	209637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_014002	TGA	2	6	209648	209653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014002	GTT	2	6	209666	209671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494868
4064	NC_014002	CGG	2	6	209686	209691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494868
4065	NC_014002	CCA	2	6	209708	209713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494868
4066	NC_014002	GTT	2	6	209756	209761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494868
4067	NC_014002	TGA	2	6	209827	209832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494868
4068	NC_014002	CTC	2	6	209859	209864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494868
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4070	NC_014002	CTT	2	6	209993	209998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494868
4071	NC_014002	ATGAA	2	10	210003	210012	60 %	20 %	20 %	0 %	294494868
4072	NC_014002	TG	3	6	210041	210046	0 %	50 %	50 %	0 %	294494868
4073	NC_014002	TGA	2	6	210100	210105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494868
4074	NC_014002	TGA	2	6	210115	210120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494868
4075	NC_014002	AAT	2	6	210179	210184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_014002	AGG	2	6	210231	210236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_014002	TGA	2	6	210247	210252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014002	AGA	2	6	210277	210282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494869
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4080	NC_014002	AGCC	2	8	210383	210390	25 %	0 %	25 %	50 %	294494869
4081	NC_014002	GAA	2	6	210407	210412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494869
4082	NC_014002	AATG	2	8	210572	210579	50 %	25 %	25 %	0 %	294494869
4083	NC_014002	CTT	2	6	210583	210588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494869
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4086	NC_014002	AGAA	2	8	210787	210794	75 %	0 %	25 %	0 %	294494869
4087	NC_014002	AT	3	6	210869	210874	50 %	50 %	0 %	0 %	294494869
4088	NC_014002	ATG	2	6	210910	210915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494869
4089	NC_014002	GAA	2	6	210916	210921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
4090	NC_014002	CAC	2	6	210928	210933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494870
4091	NC_014002	A	6	6	210955	210960	100 %	0 %	0 %	0 %	294494870
4092	NC_014002	TTTG	2	8	211002	211009	0 %	75 %	25 %	0 %	294494870
4093	NC_014002	AAC	2	6	211040	211045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494870
4094	NC_014002	CTC	2	6	211128	211133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494870
4095	NC_014002	TGAT	2	8	211151	211158	25 %	50 %	25 %	0 %	294494870
4096	NC_014002	GAGCA	2	10	211225	211234	40 %	0 %	40 %	20 %	294494870
4097	NC_014002	CTC	2	6	211268	211273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494870
4098	NC_014002	CCG	2	6	211309	211314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494870
4099	NC_014002	CATC	2	8	211355	211362	25 %	25 %	0 %	50 %	294494870
4100	NC_014002	GTT	2	6	211396	211401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494870
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4102	NC_014002	GTA	2	6	211417	211422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494870
4103	NC_014002	CAA	2	6	211616	211621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494870
4104	NC_014002	GAT	2	6	211740	211745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494870
4105	NC_014002	CTG	2	6	211757	211762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494870
4106	NC_014002	GCA	3	9	211816	211824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494870
4107	NC_014002	CTG	2	6	211856	211861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494870
4108	NC_014002	AAG	2	6	211862	211867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
4109	NC_014002	GAA	2	6	211876	211881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
4110	NC_014002	AGA	2	6	211884	211889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
4111	NC_014002	GAA	3	9	211891	211899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
4112	NC_014002	AGA	2	6	211905	211910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494870
4113	NC_014002	ATTA	2	8	211956	211963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014002	AT	5	10	211982	211991	50 %	50 %	0 %	0 %	294494871
4115	NC_014002	GCA	2	6	211992	211997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4116	NC_014002	GCA	2	6	212058	212063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4117	NC_014002	GAC	2	6	212076	212081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4118	NC_014002	GAA	2	6	212127	212132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
4119	NC_014002	GCA	2	6	212145	212150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4120	NC_014002	GCA	3	9	212154	212162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4121	NC_014002	CAG	2	6	212164	212169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4122	NC_014002	CAG	3	9	212176	212184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4123	NC_014002	CTG	2	6	212188	212193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494871
4124	NC_014002	AGA	2	6	212201	212206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
4125	NC_014002	GAA	2	6	212223	212228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
4126	NC_014002	GAA	2	6	212232	212237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
4127	NC_014002	AGA	2	6	212246	212251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494871
4128	NC_014002	CGG	2	6	212309	212314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_014002	T	6	6	212327	212332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_014002	CAA	2	6	212364	212369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_014002	AGA	2	6	212512	212517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494872
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4134	NC_014002	GTCCT	2	10	212838	212847	0 %	40 %	20 %	40 %	294494872
4135	NC_014002	GAT	2	6	212966	212971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494872
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4140	NC_014002	TTC	2	6	213281	213286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494872
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4143	NC_014002	ATTC	2	8	213466	213473	25 %	50 %	0 %	25 %	294494873
4144	NC_014002	T	6	6	213474	213479	0 %	100 %	0 %	0 %	294494873
4145	NC_014002	TTC	2	6	213662	213667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494873
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4152	NC_014002	CCGG	2	8	213945	213952	0 %	0 %	50 %	50 %	294494873
4153	NC_014002	GT	3	6	213959	213964	0 %	50 %	50 %	0 %	294494873
4154	NC_014002	GGT	2	6	213965	213970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494873
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4158	NC_014002	T	7	7	214169	214175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_014002	TA	3	6	214184	214189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_014002	AAT	2	6	214193	214198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_014002	ATC	2	6	214205	214210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4162	NC_014002	ATT	2	6	214254	214259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_014002	ATT	2	6	214274	214279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494874
4164	NC_014002	A	6	6	214338	214343	100 %	0 %	0 %	0 %	294494874
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4186	NC_014002	AAGG	2	8	215529	215536	50 %	0 %	50 %	0 %	294494874
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4197	NC_014002	T	6	6	216216	216221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4198	NC_014002	AATC	2	8	216226	216233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4199	NC_014002	CTAT	2	8	216290	216297	25 %	50 %	0 %	25 %	294494875
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4212	NC_014002	CTG	2	6	217030	217035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494875
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4217	NC_014002	CAT	2	6	217162	217167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494876
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4231	NC_014002	TGC	2	6	218103	218108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494877
4232	NC_014002	TCA	2	6	218197	218202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494877
4233	NC_014002	TCC	2	6	218207	218212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494877
4234	NC_014002	TGGT	2	8	218239	218246	0 %	50 %	50 %	0 %	294494877
4235	NC_014002	AGC	2	6	218247	218252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494877
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4240	NC_014002	T	7	7	218652	218658	0 %	100 %	0 %	0 %	294494877
4241	NC_014002	CTG	2	6	218682	218687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494877
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4245	NC_014002	TTC	2	6	218877	218882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494877
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4254	NC_014002	TTA	2	6	219261	219266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4369	NC_014002	TTA	2	6	224623	224628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494882
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4371	NC_014002	CTG	2	6	224811	224816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494882
4372	NC_014002	GATCT	2	10	224836	224845	20 %	40 %	20 %	20 %	294494882
4373	NC_014002	GTT	2	6	224908	224913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494882
4374	NC_014002	TATT	2	8	224983	224990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_014002	T	6	6	225003	225008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_014002	TA	3	6	225028	225033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4377	NC_014002	ATTT	2	8	225046	225053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4378	NC_014002	AT	3	6	225074	225079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_014002	AGG	2	6	225082	225087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_014002	TGTA	2	8	225090	225097	25 %	50 %	25 %	0 %	294494883
4381	NC_014002	TTGT	2	8	225136	225143	0 %	75 %	25 %	0 %	294494883
4382	NC_014002	CT	3	6	225144	225149	0 %	50 %	0 %	50 %	294494883
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4386	NC_014002	GAC	2	6	225429	225434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494883
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4394	NC_014002	GTCAT	2	10	225878	225887	20 %	40 %	20 %	20 %	294494883
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4397	NC_014002	TTTG	2	8	226014	226021	0 %	75 %	25 %	0 %	294494883
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4404	NC_014002	CGC	2	6	226623	226628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494883
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4406	NC_014002	T	6	6	226644	226649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4408	NC_014002	ATC	2	6	226737	226742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4410	NC_014002	TA	3	6	226805	226810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4411	NC_014002	AGG	2	6	226811	226816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4450	NC_014002	TGC	2	6	228582	228587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494885
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4483	NC_014002	A	6	6	230139	230144	100 %	0 %	0 %	0 %	294494887
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4487	NC_014002	TGG	2	6	230298	230303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494887
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4490	NC_014002	AT	3	6	230335	230340	50 %	50 %	0 %	0 %	294494887
4491	NC_014002	CCTT	2	8	230389	230396	0 %	50 %	0 %	50 %	294494887
4492	NC_014002	ATT	2	6	230483	230488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494887
4493	NC_014002	GCA	2	6	230527	230532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494887
4494	NC_014002	GAT	2	6	230543	230548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494887
4495	NC_014002	TGA	2	6	230577	230582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494887
4496	NC_014002	CTT	2	6	230720	230725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494888
4497	NC_014002	ATT	2	6	230822	230827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494888
4498	NC_014002	CTT	2	6	230894	230899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494888
4499	NC_014002	T	6	6	230985	230990	0 %	100 %	0 %	0 %	294494888
4500	NC_014002	GGC	2	6	231074	231079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494888

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